с.Южно-Подольск основан в 1906 году выходцами из деревни Подольск Горьковского района Омской области. В 1928 г. деревня Южно-Подольск состояла из 140 хозяйств, основное население — украинцы. Центр Южно-Подольского сельсовета Крестинского района Омского округа Сибирского края[2].
В соответствии с Законом Омской области от 30 июля 2004 года № 548-ОЗ «О границах и статусе муниципальных образований Омской области»[3] село возглавило муниципальное образование «Южно-Подольское сельское поселение».